女性患有卵巢巧克力囊肿的时候，在月经期的时候有可能会出现月经量的增多和痛经的症状，所以不建议女性在月经期吃过于辛辣刺激寒凉的食物，包括酒类，同时一定要注意好防寒保暖的工作，甚至腹部的保暖需要特别注意，以免刺激造成痛经更为严重。如果患者疼痛时，可以给予局部热敷的方式来进行缓解疼痛。如果不能忍受，可以口服止痛的药物来止痛。平时在月经期到来时，要注意经血的流出，保持外阴阴道的清洁卫生，再来月经期时禁止性生活的，而且女性需要及时的更换卫生巾，要保持外阴的清洁，在经期同房有可能会造成内膜异位症的加重。

对于卵巢巧克力囊肿，是不建议在月经期间来进行检查的。因为有一部分囊肿是生理期产生的，比如说黄体囊肿，储留囊肿等等。一般在月经干净后两到三天来进行超声检查，经期检查过后可以再过一段时间再进行复查以防误诊。一般首次做b超查出囊肿后，医生都会建议观察一段时间再进行复查，而且对于巧克力囊肿可以进行双合诊或者三合诊的妇科检查。但是三合诊双合诊是不建议在来月经期间进行检查的，所以在月经干净后可以进行女性的妇科内诊检查。而抽血进行血CA125的检查，也是检查巧克力囊肿的一个指标。而有一部分患者在来月经时检查CA125会出现轻度升高，而月经干净后CA125就会降低。

子宫肌瘤又称之为子宫平滑肌瘤，是长在子宫体上的，一般分为浆膜下子宫肌瘤，粘膜下子宫肌瘤和肌壁间子宫肌瘤。大多数的子宫肌瘤是不会发生癌变的。随着女性闭经后，卵巢功能萎缩，雌孕激素分泌减少，从而会导致子宫的萎缩，肌瘤也会变小，甚至萎缩消失。巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一个表现，在临床上又称之为卵巢子宫内膜移位症。它两个长的部位是不一样的，所以是有一定区别的。在临床上用于过大的巧克力囊肿，是需要进行手术治疗的。

对于巧克力囊肿的女性，即使行腹腔镜手术将其切除，但由于在手术的过程中，并不是能够100%将异位的子宫内膜组织完全清除干净，所以在手术以后，仍然可能出现巧克力囊肿复发。对于巧克力囊肿复发的女性，如果这时囊肿比较小，痛经症状又不是特别严重那可以通过药物来保守治疗，比如口服达拉唑，或者是孕三烯酮。还可以考虑直接在月经期间，服用非甾体类的抗炎药，来进行对症止痛治疗。同时对于有生育要求的女性，一般在巧囊复发以后都不是特别大，所以可以考虑尽早备孕怀孕，因为在怀孕以后巧克力囊肿就会萎缩变小，甚至是可能自愈。但如果巧囊复发以后又超过5厘米，这时保守治疗效果不佳，就只能够考虑再次行腹腔镜手术将其切除，术后需要肌注曲普瑞林来避免巧囊的复发。

卵巢巧克力囊肿又称为卵巢子宫内膜异位囊肿，主要症状是下腹痛、痛经、不孕及性交不适。不孕率高达40%。所以说怀孕几率大概是60%。引起不孕的原因复杂，如盆腔微环境改变影响精卵结合及运送，免疫功能异常导致抗子宫内膜抗体增加而破坏子宫内膜正常代谢及生理功能、卵巢功能异常导致排卵障碍和黄体形成不良等。此外，未破裂卵泡黄素化综合征在内异症患者中具有较高的发病率。中、重度粘连者可因卵巢、输卵管周围粘连而影响受精卵运输。如果巧克力囊肿直径大于4cm建议手术治疗。腹腔镜手术是首先的治疗方式。年轻、轻中度者，术后可期待自然妊娠6个月，对于年龄大于35岁，不孕年限超高3年，尤其是原发性不孕者，重度内异症、盆腔粘连、病灶切除不彻底者，输卵管不通者，应积极辅助生殖技术助孕。