导致小儿发生慢性腹泻的原因主要是因为肠道菌群失衡，因为新生儿菌群尚未形成，如果在受到细菌、病菌和真菌等多种致病菌感染后，滥用抗生素的话，就容易引起慢性腹泻。另外，长期营养不良、乳糖不耐受和喂养不当的话，也容易造成小儿出现慢性腹泻的情况。

临床上确诊慢性腹泻可以根据所出现的各种不良表现，如果发现有持续性腹泻及腹痛发烧等症状，就需要高度怀疑该病发生。同时需要借助于粪便常规检查和粪便细菌学培养检查来确定病情，且要接受消化道内镜和呼气试验方面的检查，必要时可做超声波和影像学检查项目。

当出现慢性腹泻时，西医上会建议用肠炎宁片等止泻药、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等肠道微生态制剂止泻；必要时应用补液盐防止脱水。中医上可辨证服用胃苓汤加减、葛根岑连汤加减、痛泻要方加味等中药治疗；也可以选择推拿按摩的方法止泻。

婴儿慢性腹泻的症状主要表现为精神萎靡、排便次数增多、大便不成形、腹部疼痛等等，一旦出现了这些情况，就需要引起重视，避免病情加重。如果是因为细菌或病毒感染所引起的慢性腹泻，就可能会出现体温升高的症状，极少部分患者会出现低热的情况。

小儿的消化系统发育还不是特别的成熟，肠胃功能比较差，如果饮食不当可能会导致慢性腹泻；细菌或病毒感染、着凉、不注意卫生、有乳糖不耐受问题时，也常会有慢性腹泻出现。细菌或病毒感染、着凉等引起肠炎时，还常会伴随着发烧症状。