鼻咽囊肿与鼻咽癌在本质上完全不同。鼻咽囊肿多是由于鼻咽部的咽囊，反复炎症刺激导致引流不畅，最终形成黏液潴留，导致囊肿，本质上是一种良性病变。而鼻咽癌是发生在鼻咽部的恶性肿瘤，反复炎症刺激是恶性肿瘤的一种诱因。虽然鼻咽囊肿也有炎症的反复刺激，但是癌变的可能性相对还是非常低。虽然不是一定不发生癌变，但癌变可能性非常低。要想明确具体病变，到底是鼻咽囊肿，还是鼻咽癌，需要病理作为金标准，才能最后确定。虽然能从临床表现或者局部表现做出大概判断，但是想明确诊断，还要依靠病理诊断来区分。